Bunny Tsukino, âgée de 14 ans, est une jeune fille tête en l'air et pleurnichade. Elle n'a rien d'une héroïne et pourtant, elle va rencontrer Luna, une jolie petite chatte noire avec un croissant de lune sur le front, qui va lui apprendre qu'elle est en fait Sailor Moon, une des guerrières de la Lune. Bunny n'est pas aux bout de ses surprises lorsqu'elle apprend que sa mission est de retrouver la Princesse de la Lune et son cristal d'argent, un cristal aux pouvoir très puissant. Aidée de la petite Luna qui la guidera dans sa mission, elle retrouvera au fur et à mesure de ses aventures, d'autre guerrières de la Lune qui se battrons à ses côté : Sailor Mercury, Sailor Mars et enfin Sailor Jupiter. Mais une autre personne vient aussi la sauver dès quelle est en danger, un jeune homme avec un masque sur le visage, répondant au nom de Tuxedo Mask et qui la fait complètement craquer... contrairement à Manoru, un lycéen qu'elle croise souvent et qui ne fait que l'embêter.

L'homme masqué est en fait lui aussi à la recherche du cristal d'argent cependant il continue à venir à l'aide de Sailor Moon dès qu'elle en a besoin. Bunny ne sait plus si elle doit le considérer comme un ami ou comme une rival. Cependant elle finit par apprendre sa véritable identité, et aussi étonnant que ça puisse y paraître, tuxedo masqué n'est autre que Manoru qu'elle ne pouvait supporter. Une cinquième guerrière fait elle aussi son apparition, Sailor V se disant être la Princesse Sérénité que tout le monde recherche. Pourtant, lors d'un combat où l'Homme Masqué se fait enlever par l'ennemi, Bunny s'effondre et se met à pleurer. Surprise :  ses larmes appellent alors le cristal d'argent qui apparaît aussitôt et, au dépourvu de tous, Bunny se transforme en la véritable Princesse de la Lune. La présence du cristal d'argent libère alors tous les souvenirs, Sailor V n'est pas la princesse mais seulement Sailor Venus. Quant à l'homme masqué, il est en fait le prince Endimion dont la Princesse Sérénité était très amoureuse (et réciproquement) au temps du Millénium d'Argent, et pour le sauver à tout prix du royaume des Ténèbres, elle lui avait donné un éclat de son cristal d'argent, maintenant imprégné dans son corps. En conséquence de quoi les ennemi ont donc kidnappé Manoru dans l'espoir de récupérer cet éclat.

Afin d'en apprendre plus sur leur passé encore un peu vague, Luna propose aux guerrières de se téléporter sur la Lune . Une fois arrivées à destination, les Sailor découvrent une Epée qui avait été confiée par la Reine Sérénité aux guerrières dans le but de protéger la princesse, et elles apprennent par la même occasion que celle qui est à la tête du Royaume des Ténèbres est Métallia. De retour sur Terre, les guerrières se font attaquer et découvre que Tuxedo a subit un lavage de cerveau et se trouve maintenant du côté des ennemis avec la mission de tuer la Princesse. Malgré la protection des quatre autres guerrières, Tuxedo parvient à s'introduire dans le QG des guerrières et cherche à s'emparer du cristal d'argent de Bunny. N'ayant plus le choix Bunny fini par tuer Tuxedo, mais trop triste pour continuer à vivre, elle met fin à ses jours avec l'Epée. Désespérées de la mort de leur leader et princesse, les autres guerrières décident de réunir leur force et sacrifier leur vie afin de faire renaître Tuxedo et Bunny. A présent, Bunny se retrouve seule pour lutter face à la reine Métallia.

Même seule, Bunny parvient à venir à bout de Métallia et grâce au soutien de Tuxedo et la force du Cristal d'Argent, elle redonne la vie aux autres guerrières. Le calme est l'ordre semblent être revenus mais pas pour longtemps. En effet, une étrange petite fille se faisant appeler Bunny aussi apparaît de on ne sait où et s'immisce dans la bande de Bunny . Mais elle n'est pas la seule nouvelle venue, de nouveaux ennemi débarquent de la Lune Noire et malgré leur nouveaux pouvoirs les sailor ont bien du mal à lutter contre eux. D'ailleurs Mercury, Mars et Jupiter ne tarde pas à se faire capturer servant d'appât aux ennemis qui espèrent tendre un piège à Sailor Moon.

Afin de capturer toutes les guerrières, les ennemis tentent d'enlever aussi Sailor Venus mais échouent. De  leur côté, Bunny, Tuxedo et Venus apprennent que les habitants de la Lune Noire viennent en fait du futur, ainsi que Mini Bunny et qu'ils ont plongé le Tokyo du 30ème dans un sommeil profond. Afin de venir en aide à la famille de Mini Bunny, ils décident donc de se rendre dans le futur. Arrivé à la Porte du Temps qui permet de voyager à travers les âges, ils font la rencontre de Sailor Pluton, une sailor solitaire, gardienne du Temps. Une fois arrivés dans le Tokyo du 30ème siècle, Bunny et Tuxedo ont la suprise (et l'embarras !) d'apprendre que Mini Bunny n'est autre que leur futur fille ! Ils apprennent aussi qu'il deviendront le Roi Endimion et la Reine Sérénité, à la tête de Tokyo. Cependant, Tokyo est actuellement dans le chaos et les ennemis ayant attaqué la famille royale, la Reine s'est trouvé emprisonnée dans un linceul de cristal. Manoru ayant promis de la protéger se préoccupe beaucoup du sort de Mini Bunny et au cours d'une bataille, Bunny se fera kidnapper, elle aussi, par le prince de la Lune Noire, le Prince Démon.

Bunny, ainsi que les trois autres guerrières capturées, sont retenues prisonnières dans le repère de la famille de la Lune Noire, sur la planète Némésis. En fin de compte, Bunny se rend compte que si le Prince Démon l'a kidnappé sans la tuer, c'est seulement pour la garder à lui tout seul, car il est tombé amoureux d'elle. Etouffé par le pouvoir de la Lune Noire, le cristal d'argent ne marche plus et elle ne peut se transformer en Sailor Moon pour s'échapper, elle reste donc à la merci du prince. En fait, la Lune Noire ne semble pas être dirigée par le prince lui même mais par un mystérieux vieil homme. Les avances du Prince Démon se faisant de plus en plus pesante, Bunny arrive à liberer son énergie et se transformer pour sauver les autres guerrières et s'échapper. Pendant ce temps, Mini se fait capturer par le vieil Homme. Celui ci, en modifiant ses souvenirs la manipule en lui faisant croire qu'elle n'est aimé de personne, et arrive à la rallier du côté de la Lune Noire. Elle se transforme alors en une très belle jeune femme : Black Lady. A son tour, elle hyptonisera Manoru, qui sous son charme ira voler le cristal d'argent de Bunny tandis qu'elle subtiliseras le cristal du futur. Ainsi, le vieil récupère les deux cristaux, tout en sachant que si l'un et l'autre se touche... C'est le chaos, la fin du monde.

Au moment où le Prince Démon allait réunir les deux cristaux pour mettre fin au monde, Pluton décide d'enfreindre la loi et arrête le temps, sachant que le prix à payer pour braver cet interdit est sa propre mort. Voyant son ancienne meilleure amie mourir, Black Lady se met à pleurer et redevînt Mini Bunny. De son côté, Manoru reprend lui aussi ses esprits et Sailor Moon en profite pour récupérer les deux cristaux. S'en suis une bataille de Bunny, Mini Bunny et Tuxedo contre Némésis qu'ils parviennent à vaincre. Cristal Tokyo retrouve l'ordre et le calme et les guerrières peuvent alors retourner dans le Tokyo du 20ème siècle. Malheureusement, la vie n'est pas de tout repos lorsqu'on est guerrières et d'autres ennemis, les Death Bastard, ne tardent pas à faire leur entrée. De plus leur attaque est beaucoup plus puissante les démons précédent dans la mesure où ils se nourrissent des âmes de leurs victimes et les transforme ensuite en démon... Vaincre les démons devient alors une tâche plus délicate. De plus, les sailor se trouvent affublées d'une nouvelle mission, trouver les trois talismans et les réunir. Aussi deux nouveaux personnages apparaissent, dont Frédéric et Mylène, deux élèves du lycée Infini, et Olivia une nouvelle amie de Mini Bunny.

Tandis que les Death Bastards s'affairent à voler les âmes des étudiants du lycée infini pour en récolter le plus possible, deux autres guerrières font leur apparitions : Uranus et Neptune, qui ne sont autres que Frederic et Mylène. Malgré le fait qu'elles se disent opposées aux guerrières de la Lune, elles les aident cependant lors de combats.  Ressuscitée par la Reine Sérénité du 30ème siècle, Pluton refait son apparition et il se trouve que ce sont ces trois sailors qui possèdent chacune un des trois talismans. Pendant ce temps, les guerrières de la Lune se battent contre les 5 sorcières (une sorcière pour chaque sailor) et parviennent à en éliminer cinq....

Uranus, Neptune et Pluton se révèlent être en fait des guerrières d'un autre système solaire, les outer senshi, avec des pouvoir supérieux aux inners senshi (les guerrières de la lune). Leur mission est de vaincre les Death Bastard mais aussi de tuer Sailor Saturne, la sailor de Destruction. Seulement Bunny apprendra pas la suite (juste après l'apparition du St Graal) que Saturne n'est autre qu'Olivia, l'amie de Mini Bunny et s'opposera aux Outers pour ne pas qu'elles la tuent. Mais Olivia n'est pas seulement Sailor Saturne, guerrières du Chaos, mais aussi la fille du professeur Tomoe (fondateur de l'école Tomoe). Dans son enfance, elle avait été gravement blessée lors d'un accident, et afin qu'elle survive, son père avait robotisé son corps et y avait implanté un démon. Au moment où Bunny s'opposent aux Outers pour ne pas qu'elles tuent Olivia, celle-ce laisse alors échapper le démon qui est en elle et se transforme en  Mistress 9. Mistress 9 se trouvent être une ennemi du côté des Death Bastard dont le maître suprême est Pharaonix (ou Pharaon 90).

Mistress 9 n'a pas réussi a prendre intégralement le corps d'Olivia car malgré le fait qu'elle vole l'âme des guèerrières et de Mini Bunny, Olivia continue de lutter à l'intérieur de son corps pour sauver leur âme. Même si Bunny se transforme en Super Sailor Moon grâce aux St Graal, tout le monde perd de l'énergie lors de la bataille. Buny se retrouvant toute seule aux combat, elle décide de sauter dans le Pharaon 90 et de le vaincre de l'intérieur, mais ce faisant, elle libère l'âme de Saturne qui se réveille enfin. Celle ci décide d'utiliser de son pouvoir, au prix de sa vie, et part cette dernière attaque d'une puissance indéniable, le Pharaon 90 est vaincu. Etant élu pour être le sauveur, la seul pouvant se servir du pouvoir infini du St Graal, Bunny ne meure pas et use même de son pouvoir pour faire revivre Saturne, qui renaît alors comme un nouveau né. C'est un nouveau départ, les Outers décident de repartir en prenant Olivia sous leur aile afin de l'élever.

Ce manga est un Hors série (une petite pause dans l'histoire) qui sera consacrée à Luna. Celle ci va tomber amoureuse d'un Humain (au grand dépit d'artémis) mis en danger. Elle fera tout pour le sauver aux côtés de Sailor Moon, et à la fin son plus grand souhait s'exaucera, soit celui d'être transformée en femme. Pendant son court instant sous la forme d'un être humain, elle échangera son premier baiser d'amour avec l'homme dont elle était amoureuse. S'en suis 3 autres mini histoires Bonus sur les sailors et les examens.

Lors d'une éclipse solaire, de nouveaux ennemis font leur apparition afin d'envahir le rêve des gens par leurs cauchemars. Ils sont en fait à la recherche du cristal d'or. Mini Bunny fait alors la connaissance de Pégase qui pense qu'elle celle qui pourra faire enfin apparaître le cristal d'or. Quant à Mamoru, il tombe malade et son cas semble s'aggraver de jours en jours... De leur côté, les guerrières ont bien du mal à se battre contre les nouveaux ennemis, car mis à part Bunny, les autres ont perdus leur pouvoirs. Lors d'un face à face avec les Dead Moon, Mercury réussi à libérer son pouvoir qui fera apparaître son propre cristal. Suite à Mercury, c'est au tour de Mars de s'opposer aux Dead Moon et faire apparaître son cristal....

Suite à Mars, c'est Jupiter qui va réveler son propre cristal, tandis que Venus, elle, est persuadée qu'elle n'arrivera pas à récupérer le sien. De plus en plus souffrant, Mamoru a peur d'être un boulet pour Bunny et décide l'éviter mais celle-ci finit par se rendre chez lui et le découvre mourant. En fait, on apprend que Mamoru à une tâche au poumon en forme de rose noire, symbole de la corruption... Enfin, Venus décide de se rendre à un piège que les Dead Moon lui ont lancé, et tant bien que mal (avec l'aide de son chat Artemis) elle parviendra à en sortir saine et sauve et récupérer son cristal.

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Ce volume commence en nous montrant la nouvelle vie des Outer qui élève la petite Olivia. Leur vie est bien paisible mais Olivia se met à grandir de façon anormale, elle offre alors aux Outers leurs cristaux et les previens que les Inners ainsi que Mamoru sont en danger et ont de nouveaux ennemis. Effectivement, les inners ont été prise au piège par le Quartel des Amazones et le pire est que Bunny est elle aussi contaminé par le mal de mamoru. Zirconia (un autre Dead Moon) en profite pour les faire rajeunir, et Pégase, qui se trouve être en fait aussi un Humain prisonnier dans un corps de cheval (il s'appelle Hélios) les emmène dans son Royaume Elusion, la Terre protectrice afin de les maintenir en vie et reprendre une forme normale. Une fois normaux, Mamoru et Bunny retourne sur Terre où la Reine Nérénia s'est installé se disant être la véritable souveraine du Royaume de la Lune. En essayant de s'infiltrer dans le QG des Dead Moon, Mini Moon et Saturne se font piéger et emprisonner tandis que les guerrières sont en plein combat avec Zirconia qui parvient à tuer Endimion et Sérénité.

On apprend que la mort du prince et de la princesse n'était qu'une illusion pour mettre le doute dans l'esprit des guerrières et les perturber dans leur combat. Cependant elle réussissent tout de même à le tuer tandis que Sailor Moon sauve Mini Moon et Saturne toujours prisonnières. Les sailors partent alors aux trousses de Nérénia qui est partie en Elusion, se battent, et malgré quelques révélations déroutantes finissent par la vaincre. En fin de compte, celui qui détenait le cristal d'or n'était autre que Mamoru qu'il révéla grâce à l'aide de Bunny. Quant à Mini Bunny, elle révèle enfin son propre cristal, le cristal rose lunaire. Afin de remettre l'ordre sur la Terre, Bunny et Mamoru se transforme en Endimion et Sérénité et usent  de leur cristaux pour y parvenir. Sérénité en profite par donner aux Quartel des Amazones leur véritable apparence, soit celle de guerrières Sailor. Elles sont en fait les quatres guerrières protectrices de Mini Moon dans le futur, comme Mercury, Mars, Jupiter et Venus le sont pour Bunny. Le temps est venu de quitter Elusion et de retourner sur Terre, Mini Moon fait ses Adieux à Hélios dont elle est amoureuse...

Encore une fois, la quiétude est de courte durée pour les guerrières car de nouveaux ennemis ne tardent pas à apparaître dont le but est de voler le star seed des gens, sans lequel on ne peut survivre. Autre mauvaise nouvelle pour Bunny, Mamoru a décidé de partir étudier aux Etats-Unis pendant un an. Elle décide de l'accompagner à l'aéroport où elle verra Mamoru se faire prendre son Star Seed sous ses yeux, mais s'évanouissant sous le choc, elle ne croira pas à ce qui est arrivé et n'acceptera pas le fait que Mamoru puisse être mort.  Elle tente toutefois de prendre goût à la vie, de plus que maintenant, les sailor sont au lycée et qu'elles vont faire connaissance de trois idoles du  célèbre groupe Three Light (Seiya, Yaten et Taiki). Recevant de temps en temps des cartes postales sans texte, Bunny se met en tête que c'est Mamoru qui lui écrit des Etats Unis mais qu'il est trop occupé par ses études pour lui écrire. Une petite fillette de 3 ans, Chibi Chibi,  fait son apparition sans que l'on sache d'où elle vient, et ressemble indéniablement à Bunny. Aussi, trois nouvelles guerrières (Sailor Star Fighter, Healer et Maker) apparaissent et se révèlent n'être autre que les Three Light ; elles sont sous la forme d'un homme en civils mais deviennent femmes en se transformant en sailor star. Celles-ci ont fui leur planète ruinée par ces nouveaux ennemis et sont à la recherche de leur Princesse qu'elles espèrent retrouver en chantant leur chansons. Les combats se poursuivent mais les ennemis sont plus puissants que les précédents et à chaque lutte, une guerrière se fait voler son star seed et meurt. Mercury, Mars, Jupiter, Venus et même les corbeaux gardien de Mars (Phobos et Dimos) se font éliminer. Finalement, les Starlights finissent par retrouver leur Princesse Canelle (Kakyû pour la version japonaise) qui s'était réfugiée dans le mystérieux encensoir de Chibi Chibi. A la fin du Volume, Seiya alias Sailor Star Fighter fait comprendre à Bunny que Mamoru lui aussi est mort en perdant son Star Seed...

Les Sailor Starlights décide de venir en aide à Sailor Moon pour vaincre Galaxia, leur nouvelle ennemie, une sailor redoutable qui a décidé de capturer tous les Star Seed afin d'avoir la Galaxie sous son contrôle. Chibi Chibi dont les pouvoir finissent par se révéler est en fait une sailor elle aussi, bien qu'on ne sache toujours pas qui elle est. Bunny qui se retrouvera seule face à Galaxia ne parviendra pas à la vaincre et sera sauvée in extremis par Sailor Chibi Chibi. Néanmoins elle découvrira que même les Outers senshis sont mortes, leur Star Seed volés aussi... Bunny à l'aide des Starlight et de leur princesse décide d'aller en territoire ennemi mais les combats tournent à leur désavantage et finalement, seule Bunny survivra. A Cristal Tokyo, dans le futur, Mini Bunny qui était rentrée chez elle après avoir vaincue Nérénia se rend compte qu'il y'a quelques troubles dans le passé et décide de retourner au 20siècle en compagnie de ses gardiennes, le Quartel Amazone, afin de leur venir en aide.

De retour dans le passé, Mini Moon retrouve Sailor Moon et la princesse Canelle et découvre Chibi Chibi, mais contrairement à Bunny, ne pense pas qu'elle soit da deuxième fille. D'autres sbires de Galaxia arrivent et finisissent par tuer Kakyû. Bunny perd alors tout courage quand elle découvre que ses prochain adversaires ne sont autres que ses anciennes amies, du moins leurs corps sous la tutelle de Galaxia. Bunny ne se sent plus assez forte pour combattre ses propres amies et se laisse battre jusqu'à ce qu'elle reprenne foi en la victoire et tue ses adversaires grâce au cristal d'argent. Cependant Mamoru survit et s'enfuit retrouver Galaxia, Bunny à ses trousses. Elle y découvre avec surprise Galaxia devant un chaudron, le Chaudron Principal. Il est la source de la galaxie, là où tout se crée et où naissent tout les Star Seed. Galaxia pousse alors Mamoru dans le chaudron afin de le tuer définitivement ainsi que tous les Star Seed qu'elle a volé aux différentes sailor. Et là Galaxia se dévoile comme n'étant pas le véritable ennemi mais une marionnette au mains de Chaos qui a réussit à lui faire venir le plus grand Star Seed de la Galaxie, soit celui de Sailor Moon. Galaxia meurt à son tour et Bunny se croit perdue quand Chibi Chibi se transforme en Sailor Cosmos et lui conseille de porter Chaos en elle et de se plonger dans le chaudron primordiale afin de s'y dissoudre, Chaos avec elle. Quitte à y perdre la vie, Moon s'exécute et saute dans le chaudron... Le Quartel Amazones étaient les seules sailor encore vivante ne comprenne pas le choix de Sailor Cosmos et celle ci leur apprend qu'elle est en fait la véritable apparence de Sailor Moon, mais qu'elle est aussi sa mère (ouais ça se complique, même moi j'ai pas tout compris ! ^_^). Cosmos a eu aussi à faire avec Chaos mais avait fuit le combat et elle ne voulait que l'histoire se recommence encore une fois, c'est pourquoi elle a conseillé à Sailor Moon d'affronter sa situation. Une fois dans le chaudron (même si elle est dissoute... lol), Moon retrouve la chaleur et l'amour de ses amies et de Mamoru. La gardienne du Cosmos se montre alors et demande à Bunny ce qu'elle souhaite pour l'avenir. Celle ci répond qu'elle aimerait revenir à la vie ainsi que tout son entourage afin de pouvoir vivre comme avant. Son voeu exaucé, tout redevient comme si il ne s'était rien passé, les Starlights repartent sur leur planète en compagnie de leur princesse, et le manga se termine par... Le Mariage de Bunny et de Mamoru ! Comme c'est beau ! T_T